Innkirtlakerfið virkar sem stjórnkerfi sem seytir efnaboðum, kölluðum hormónum. Hormónin dreifast um hjarta- og æðakerfið og hafa áhrif á fjarlægar frumur í tilteknum marklíffærum þar sem þau stjórna ýmsum störfum.
Nokkur hormón frá undirstúku og heiladingli í heilanum stjórna seytingu annarra hormóna í öðrum líffærum. Þessi stjórnun á sér stað með svokölluðum afturvirkum áhrifum. Undirstúkan er það svæði í heilanum sem ber ábyrgð á flestum störfum bæði innkirtlakerfisins og sjálfvirka taugakerfisins.
Undirstúkan er það svæði heilans sem ber ábyrgð á flestu sem tengist bæði innkirtlakerfinu og sjálfvirka taugakerfinu. Undirstúkan sendir hormóna- og taugaboð til heiladingulsins, sem aftur seytir ákveðnum hormónum eins og vaxtarhormóni, sem stendur fyrir vaxtarhormón.
- Heilaköngullinn - stjórnar dægursveiflunni
- Heiladingull - hefur áhrif á önnur innkirtlakerfi
- Skjaldkirtill - hormón sem hafa áhrif á efnaskipti
- Hóstarkirtill - mikilvægur hluti ónæmiskerfisins
- Nýrnahettur – hormónin kortisól og adrenalín
- Briskirtill - hormónin insúlín og glúkagon
- Eggjastokkar
- Eistu