Hrana koja nije imala vremena da se razgradi i apsorbuje stiže do debelog crijeva u roku od 2-7 sati.
Ovdje se apsorbira samo mali dio hranjivih tvari. Uglavnom se apsorbiraju soli i voda. Voda se apsorbira u značajnim količinama.
Ovdje se odvija određena razgradnja dijetalnih vlakana uz pomoć milijardi bakterija koje se nalaze u crijevima i koje su dio crijevne bakterijske flore. Kada se one razgrade, aktivnošću bakterija nastaju plinovi. Ti plinovi su CO2, metan i vodik.
Čini se da bakterije mliječne kiseline i dijetalna vlakna pozitivno utiču na sastav bakterija. Debelo crijevo svakodnevno prima jednu do dvije litre razgradivih produkata. Oni se u debelom crijevu zadržavaju tri do deset sati. Uz pomoć valovitih pokreta koji se javljaju kada se crijevni mišići kontrahuju, oni se transportuju niz crijevo.
Donji dio rektuma je proširen i stoga može sakupiti nešto stolice prije nego što se crijevo mora isprazniti. Oko analnog otvora nalaze se dva mišića u obliku prstena, nazvana sfinkteri, od kojih se jedan može kontrolirati voljom. Pokreće se refleks koji uzrokuje kontrakciju debelog crijeva i rektuma kako bi se izbacila stolica.